纯棉合股纱和纯棉单纱在以下几个方面存在区别：
结构差异：
纯棉单纱：由单根棉纤维经过加捻制成，纱线结构简单。纯棉合股纱：由两根或两根以上的纯棉单纱合并加捻而成，纱线结构复杂。
强力：
纯棉合股纱：由于纱线合并，纱线直径增大，强力通常比单纱更强。
耐磨性：
纯棉单纱：耐磨性相对较差。纯棉合股纱：由于纱线结构更紧密，耐磨性较好。
弹性：
纯棉单纱：弹性较好，但合股后弹性会略有下降。纯棉合股纱：弹性相对较差。
手感：
纯棉单纱：手感较细腻。纯棉合股纱：手感较粗糙，但更结实。
用途：
纯棉单纱：适用于制作一些对强力要求不高的织物，如内衣、袜子等。纯棉合股纱：适用于制作对强力、耐磨性要求较高的织物，如牛仔布、休闲服等。
成本：
纯棉单纱：成本较低。纯棉合股纱：成本较高。
总之，纯棉合股纱和纯棉单纱在结构、强力、耐磨性、弹性、手感、用途和成本等方面存在一定差异。选择哪种纱线应根据具体的应用需求来决定。